No início, o aplicativo era gratuito tanto para os taxistas quanto para os usuários, mas cerca de seis meses atrás foi instalada uma nova política de pagamento: 9% é o valor da comissão das corridas feitas pelo app.
Hoje, a 99Taxis possui 100.000 táxis em sua frota, sendo 30.000 somente na maior cidade do Brasil, São Paulo. O serviço surgiu depois que um dos cofundadores foi para a Alemanha e lá utilizou um serviço similar chamado MyTaxi.